1、冷却水系统由于上开式系统，冷却水经冷却塔完全与空气接触，在冷却的同时，还将大量空气中的灰尘等杂质引入水系统，沉积在冷却塔、空调机组和管道中形成淤泥，降低循环水量，影响热交换。
  2、系统投入使用后，因安装时残留在系统内的焊渣、铁屑、泥土、油污等杂质也会聚积在系统里；焊渣、铁屑等坚硬物质则会附着在换热设备表面，影响换热。 
  3、冷却水因与空气接触，在冷却塔内和管道内会滋生藻类、细菌等微生物，死后的尸体与淤泥、油污等杂物粘附在一起，附着在设备和管道上，影响循环水量及换热，同时，微生物和沉积物的产生，促使电池浓密腐蚀及垢下腐蚀电池的产生，从而使金属腐蚀速度加快。由于经常使用自来水通过水箱换水来补充冷冻水系统，也会出现以上现象。
  4、冷却系统温度较高，且均采用自来水，其Ca2+、Me2+离子受热后形成碳酸盐水垢，附着在热设备和管道中，因水垢的导热系数0.464~0.697W/M.K，碳钢的导热系数为46.4~52.2W/M.K，只有碳钢的1%，降低换热设备的传热效果，引起运行成本增加。